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国内首发 ! 新格元携手凯莱谱打造单细胞测序+代谢组学联合解决方案

发布时间:2021-03-15 16:53:58阅读次数:298
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3月10日下午,新格元生物科技有限公司和杭州凯莱谱精准医疗检测技术有限公司正式签署战略合作协议。此次合作,双方将共同开展靶向及非靶向代谢组学及海量单细胞测序服务,充分发挥双方在各自领域的优势,为客户提供联合解决方案。

代谢组与单细胞技术联合方案依托于凯莱谱多组学生物标志物质谱检测平台,结合新格元自主开发的GEXSCOPE®海量单细胞转录组测序、单细胞免疫组库测序技术,以期为肿瘤微环境和免疫微环境研究提供多组学、多层次的见解,进而为生物标志物的发现与验证提供细胞水平的解决方案。

“人类基因组计划”启动至今的30余年里,各种组学研究纷至沓来。伴随着鼓舞人心的海量单细胞转录组数据的发表,代谢组学在肿瘤微环境[1,2]和免疫微环境[3,4]中的应用也渐成趋势。代谢组处于基因调控网络的下游,刻画中心法则的终端信息,为解析细胞代谢异质性提供多组学、多层次的见解。

 

就本次双方合作

#  新格元CEO方南博士指出:

“新格元拥有端到端的单细胞测序系统,可提供从组织样品处理到数据分析和挖掘的全流程解决方案,致力于将突破性的单细胞分析技术应用于临床检测、健康管理和药物开发领域。我们很荣幸能与凯莱谱精准医疗展开合作,共同推进单细胞技术和代谢组技术的深度联合。两家公司强强联手,将共同打造精准医学、代谢诊断的新技术服务体系。”

#  凯莱谱CEO刘华芬女士表示:

“凯莱谱致力于多组学数据驱动产品创新,为中国用户打造临床质谱标准化实验室提供专业的一站式整体化解决方案。此次联合新格元提供单细胞测序整体解决方案,打通上下游多组学研究和数据分析的全流程,将领先的单细胞测序和高质量的代谢组学技术相结合,以期为国内科学家提供前沿、精准、高质量数据和分析结果。”

 

#  未来合作预期:

以血液病研究为例,血清代谢组结合海量单细胞测序技术可以识别的血液中30余种免疫细胞[5],我们可以得到:

  • 细胞图谱 

    分别探究不同样本的细胞类型组成及占比,结合单细胞免疫组库分析TCR/BCR克隆多样性;

  • 转录因子调控网络  

    关键细胞类型的代谢相关基因转录调控机制;

  • 细胞轨迹  

    细胞亚群内细胞拟时序分析,推断细胞分化进程或转移状态;

  • 代谢分析    

    血清代谢物定量,生物标志物筛选;代谢基因联合分析推断细胞亚群代谢异质性;

  • 代谢组与单细胞关联分析

        探究不同免疫细胞对代谢谱的响应,在细胞层面阐明疾病机理。

 

#   研究案例:

文章题目:Multi-Omics Resolves a Sharp Disease-State Shift between Mild and Moderate COVID-19

期刊:Cell

发表时间:2020年12月

华盛顿大学的Heath教授等人利用多组学技术解析了轻度和中度COVID-19患者之间的急剧变化状态,通过采集139名不同程度COVID-19感染者确诊后的第一周内的连续抽血样本,综合患者的临床指标、PBMC单细胞多组学分析和血浆代谢组、蛋白质组综合分析结果,发现从轻症到中度感染发生了包括炎症信号升高、伴随特定种类代谢物和代谢过程丧失等主要改变[6]

 

轻度感染与中度或严重感染之间存在明显的免疫反应差异。在病情较重的患者中,出现了多种不同寻常的免疫细胞表型,它们随着疾病严重程度的增加而放大。与此同时,住院患者的代谢产物也出现了异常——病毒感染对患者的免疫反应要求越来越高,但代谢产物却在消失。将超过120,000个免疫特征浓缩成一个轴,以捕捉不同免疫细胞如何协调对SARS-CoV-2的反应。这个免疫反应轴与主要的血浆成分变化、临床凝血指标以及轻度和中度感染之间的急剧转变相一致。这项研究表明,中度感染可能为治疗干预提供最有效的环境。

 

关于新格元

新格元生物成立于2018年,专注高通量单细胞多组学平台产品的自主开发及临床转化。公司成立后发展迅速,现已拥有国际领先的一站式高通量单细胞测序平台,提供从组织样本处理,高通量单细胞分离及测序文库构建,到数据分析和临床意义挖掘的全面解决方案。现有产品包括自主开发生产的 Singleron Matrix™自动化单细胞测序文库构建仪器,GEXSCOPE®高通量单细胞转录组试剂盒、单细胞核转录组试剂盒、免疫受体试剂盒,FocuSeq™靶向高通量单细胞测序产品,CeleScope™生信分析软件,及 SynEcoSys™单细胞数据库,并已服务300余家知名医院,药企,及科研院所。

 

关于凯莱谱

杭州凯莱谱精准医疗检测技术有限公司总部位于浙江杭州,是一家以创新质谱应用为核心技术,致力于多组学数据驱动产品创新战略的生物技术公司。公司秉承“用创新诊断成就健康生活”的使命,业务重点围绕临床诊断、多组学研究、生物标志物发现和转化三大应用方向,将多组学数据研发转化、临床质谱试剂与仪器自主研发生产及中心实验室服务等多种业务模式融合创新,推动多组学技术在中国临床精准诊疗领域的应用。 

 

参考文献

[1] Xiao, Z., Dai, Z. & Locasale, J.W.  Metabolic landscape of the tumor microenvironment at single cell resolution. Nat Commun 10, 3763 (2019). 

[2] Karin, Ortmayr, Sébastien, et al. Metabolic profiling of cancer cells reveals genome-wide crosstalk between transcriptional regulators and metabolism.[J]. Nature     Communications, 2019.

[3] Maxim N. Artyomov Jan Van den Bossche. Immunometabolism in the Single-Cell Era Published:October 06 2020.

[4] Karmaus P W F , Chen X , Lim S A , et al.  Metabolic heterogeneity underlies reciprocal fates of T H 17 cell stemness  and plasticity[J]. Nature, 2019.

[5] Xiaowe Xie, Mengyao Liu, , et al.  Single-cell Transcriptomic Landscape of Human Blood Cells, National Science Review, , nwaa180.

[6] Su Y, et al. Multi-Omics Resolves a Sharp  Disease-State Shift between Mild and Moderate COVID-19. Cell.2020 Dec 10;183, 1–17.

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